事实婚姻是指没有经过正式结婚仪式，但是在事实上已经过了夫妻生活的一种婚姻关系。由于没有经过正式结婚程序，因此离婚的程序也相对比较简单。

首先，双方应当协商决定离婚，该协议应当写明离婚日期和离婚协议内容，双方应当签字并加盖指纹确认。这个离婚协议可以由律师起草，并且律师也应当参与双方离婚协议的谈判过程，以确保双方的合法权益得到保障。

其次，离婚协议需要提交至当地居民委员会或者民政局进行审核。审核需要双方身份证、结婚证、离婚协议等证明材料。

最后，审核通过以后，民政局会发放离婚证书。

对于孩子的抚养权问题，应当首先由双方协商决定，根据实际情况按比例分配抚养权和抚养费用。如果协商不成，可以通过诉讼的方式向法院申请解决此类问题。

在处理孩子抚养权问题的过程中，需要考虑到孩子的利益，尽可能保障其权益，避免给其造成过多的伤害。

总之，事实婚姻的离婚程序相对比较简单，但是在解决孩子抚养权问题上也需要倍加注意，以确保孩子的合法权益得到保障。在离婚的过程中，双方要维护彼此的尊重，尽可能地减少出现冲突。